上海崧澤遺址博物館位于上海市青浦區趙巷鎮崧澤村，總用地約1.3萬平方米，總建筑面積3680平方米。上海崧澤遺址博物館定位為“遺址保護管理、出土文物收藏、學術研究、鄉土史教育及文化休閑旅游”，將成為遺址保護、考古研究、文物收藏的平臺，了解上海鄉土歷史的場所。
主展廳由“發現崧澤遺址”“走進崧澤社會”“傳承崧澤遺產”三部分組成。